Arquivos duplicados ocupam espaço no disco rígido e, em sua grande maioria, são inúteis, removê-los acaba sendo, portanto, a única coisa plausível a ser feita. Contudo, fazê-lo de forma manual pode ser muito cansativo e, além disso, muito chato. Com isso em mente, o que você pode fazer para se ver livre de arquivos assim é usar um programa localizador de duplicatas, e esse aqui é um dos melhores do mercado.
